스트로마톨라이트(stromatolite)는 남조세균(藍藻細菌: 엽록소를 가지고 광합성을 하는 세균)에 의해 만들어진 생물 기원의 퇴적 구조로 선캄브리아기(지각이 형성된 약 46억 년 전부터 다양한 생물이 화석으로 보존되기 시작한 캄브리아기 직전(약 5억 4,200만 년)까지의 시대) 이래 생물의 층서연구에 매우 중요한 화석이다. 스트로마톨라이트의 형태, 산출환경, 구성생물, 형성시기는 매우 다양하다. 형성 환경은 주로 해수나 담수 등 물이 풍부한 곳이다. 스트로마톨라이트는 초기 지구 생명체의 기원에 대한 증거들을 제공하고 초기 지구의 형성과정에 대한 해답을 제시한다. 또한 박테리아 및 미세조류(微細藻類: 식물플랑크톤으로 자연계의 먹이사슬에서 최하위에 위치하여 광합성을 통해 유기물을 생산하는 독립영양생물)의 진화과정을 밝히는데 큰 도움이 된다.